Кто запустил компьютеры: сделайте Пожалуйста замеры всех напряжений на микросхемах: CPU, ROM-RAM, FLASH, Логика (+5в).
Я уже подумываю посерьезней замудрить с питанием что нибудь,
Занижение или превышение допустимого напряжения может влечь за собой нагрев микросхемы с выделением какого то количества тепла, допуски приводятся в datasheet. Сильный нагрев проявляется при залипании одного или нескольких выводов, и превышении напряжения сверх допустимого, либо превышение нагрузочной способности микросхем.
Из за неправильной прошивки я думаю нагрева быть не должно, по крайней мере не до 60`C , ну и не большинства микросхем.
Еще как вариант, поставить на плисины и процессор, радиаторы чипсетов, снятые с писишный МВ.