По плечу -5В должно быть крайне малое потребление тока. Т.е. никакого нагрева там быть не должно.
Учитывая...
Начать с мега-внимательной проверки монтажа. Для начала уделить внимание цоколёвки КР1168ЕН5А и правильности её впайки в плату. Ну и крайне желательны фото в хорошем разрешении обоих сторон собранной платы.
Ну и в заключении традиционное: "данный комп при исправных деталях и правильном монтаже работает сразу и не нуждается в дополнительной настройке". p.s. Некоторые первые версии плат, которые модифицировались ужЕ на этом форуме, имели ошибки как раз в зоне питания.