Пожелания:
1) не надо smd
2) не надо менять ПЗУхи: если для кого-то 2764(рф4) такая уж редкая - возьмите at28c64b. РТ4 тоже везде навалом и программатор самодельный есть на этом форуме
3) преобразователь питания поменять на современные DIP или SIP DC/DC конвертеры. Мощность там нужна смешная.
Тяга к ATX - зло. Зачем таскать этот гроб? Давно есть малюсенькие мощные 5В питальники. Исключение: 12V для 5.25" дисковода (у меня, например, встроенный БП во внешнем дисководе). Для 3.5" вообще 12В не надо, а разницы (кроме удобства) нет. Я даже 8" запитал от маленького блока и DC/DC конвертер.
Вот еще для 5.25" флопа. Когда надо прочитать 5.25 дискеты - достали флоп с питальником. В остальное время 3.5". А ATX сразу съедает кучу места.