Заменить TL712 идея хорошая, нужно пробовать разные варианты, у меня кстати игры с турбо-загрузкой идут.
Вот все компоненты перевести в их SMD-аналоги мне кажется не надо, это усложняет процесс сборки для простых любителей.
Насчет полигона для стабилизатора не понял.
Вот джойстик приколхозить надо, он ведь у Superfo есть.