Если есть хороший осцил, посмотри что происходит с сигналом CAS (особенно его отрицательный фронт) при подключении SignalTap.
Без схемы трудно советовать, но по логике - либо SignalTap становится "подтяжкой лог.уровня", либо "заваливает" фронты сигналов.