Если сначала был залит образ NOTEMPTY.IMG, то файлы на нём были. Образ imageCE00.img перезаписывает только первые 16 килобайт, остальная инфа не должна портиться...
Давайте ещё так попробуем: даю временную ссылку на образ моего диска (простая SD флешка о 256М объёму, через неделю удалю), http://stavipk.ru/asdio/256.zip Там большинство дисков имеет информацию (редакторы, игры, бейсик, системные). Попробуйте перезалить его полностью и апробировать.