А дело не только в смене разрешения. Софт, который работает на уровне драйверов, пытается отследить полноэкранные приложения, и исказить их, "улучшая" в соответствии с выбранной настройкой. Для чего и пришлось сделать вид, что размер моего окна не совпал с экраном.