Оказалось, что ISA шина в MAME работает сильно быстрее, чем предусмотрено в MXONPC, поэтому попадаются серии из 50 и больше одинаковых отсчетов, которые считаются за ошибку "нет сигнала данных". Если искусственно замедлить процессор в 2 раза, ошибка уходит.