Gerber - профессиональныq формат представления печатной платы, служащий для изготовления плат промышленным способом. Если сканированную картинку платы нужно "чистить" или подгонять размеры или соосность отверстий, то наверное лучше ее просто перерисовать сразу в гербер. Постараться для нас, ленивых...
Тогда потом просто отдаешь на завод гербер, платишь, забираешь платы.