В твоем случае дело похоже не в переходнике (он же пассивный - просто проводники между двумя разъемами), а самих CF. Я тоже одни и те же CF не в каждой схеме смог запустить. А вот с адаптером SD->IDE (адаптер на базе микроконтроллера) еще и сам микроконтроллер может вносить баги в протокол.