В описании ДОС говорится, что файлы должны находится на одном диске, запускается SE.COM
Про отдельный запуск SE.EXE ничего не сообщается.

"5.5 Графическая операционная оболочка RK-DOS

Оболочка предназначена для большего удобства выполнения операций копирования,
переименования и удаления файлов и использует "НОРТОНО"-подобный интерфейс. Па-
кет оболочки состоит из двух файлов:
SE.COM - стартовый файл программы
SE.EXE - дополнительный (оверлейный) файл с кодами
Оба эти файла должны находиться на одном диске. После запуска (командой SE<ВК>)
выводится таблица в три колонки с именами всех файлов, имеющихся на текущем
диске."