Этот аспект слабо отражён в справочной литературе по контроллерам. Относительно механизма реализации - я вообще ничего не видел.
На обычном реальном диске.как такового пустого места на диске нет
Когда речь идёт о максимально точном воспроизведении всех аспектов работы оригинального контроллера - интерес представляет и то, как он работает на "неполных" дорожках.