Питание от USB еще не гаранития того, что все хорошо заземлено. А если у тебя розетки без общего заземления, то и вообще. Вообще было бы интересно взять пробу, намотать на нее маленькую антеннку-петлю и поводить вдоль проводов там и сям, поискать осциллографом где фонит. Правда, не факт, что в таком случае не поймается что-то, наведенное самим осциллографом.
Еще у DE1 есть клемма для общего зануления, можно ее с корпусом компьютера объединить.

