Вообще-то в первую очередь надо проверить, а нет ли косяка на сигнале записи в ПЗУ? (там, вроде бы еще резистор стоял навешанный с обратной стороны платы прямо на ножки микросхемы, подтягивающий сигнал WE к питанию.) Не уверен, разведен ли он на плате. Поначалу его не было.
---------- Post added at 22:11 ---------- Previous post was at 22:10 ----------
А ВГ-шка то хотя бы трепыхается?
В смысле сигналы на дисковод какие-нибудь доходят?



Грешу либо на кеш, который включал так от бедности 
( сборка 95%, далее потребуется прошивка и заливка софта)
ScorpEvo ZS 1024 turbo+ CF-HDD/FDD/Mouse/SMUC 3.1/ProfROMse/NeoGS/ZC