Забавно, что оказалось сложнее адекватные данные кодировать в импульсы,
чем импульсы в адекватные данные.

А всему виною, специфический для контроллера РК НГМД синхробайт. Для него нет верной формы записи в виде байта.
Байт 06h используется чисто символически. На схему контроллера прямо подается команда сформировать специальный синхробайт.
А образ на диске из байт состоит. Ну, наверное вы поняли.