Объясните, зачем в этой схеме диод и резистор?
Имитирует выход с открытым коллектором. Т. к. на шине могут быть несколько устройств, вход SIO работает по принципу «проводное И». Резистор - подтяжка шины.

Если это элементы на оранжевом (orange) проводе не мешало бы узнать чем является элемент с выводами 12\13? Операционный усилитель или буферный элемент типа инвертор (повторитель).
Это внутренний элемент MAX232 — он как бы инвертор со смещением уровней (делает RS232 — ТТЛ).