хреново что перепутал. у тебя ведь один пин выход, а второй вход. могла и обидеться на такое...

ну посмотри уже ПДФ, что я тебе дал! там всего три странички.
ДА, подключать все выводы питания, т.к. jtag подключен к разным power domains (как я это себе понимаю). ну и естессно VCCINT и земли тоже все дложны быть подключены.
с АВР имел дело? если да, то должен знать прикол с питанием порта А (или то С был?) от AVCC. здесь аналогичная история.