Можно поставить 2 FPGA, одну нежирную MAX, толерантную к 5В, и другую - пожирнее, но с меньшим количеством выводов. Интерфейс между ними не принципиален, хоть SPI, но на высокой частоте. Ещё круче, если MAX сможет загружать произвольную прошивку во вторую FPGA (а-ля sprinter).