Контроллер клавиатуры для "Пентагон-128" на ATMega8/48/88/168/328

[EvgenRU]

AVCC, AREF и второе GND я так понял подключать не обязательно, но если подключено - это не может повлиять на работоспособность схемы?

Если подключено, то это даже лучше.

А фьюзы правильные ставлю - lfuse:w:0xEE:m -U hfuse:w:0xD5? Для ATMEGA48?

Ну да, я вроде такие и рекомендовал для этой прошивки.
Можете еще попробовать такие
-U lfuse:w:0xee:m -U hfuse:w:0xdd:m -U efuse:w:0xff:m

а с чем связана уборка подтяжки clk/dat какие мотивации?

С тем, что в клавиатуре она есть, в самом контроллере по заверению производителей.
Чтобы не быть голословным - процитирую "Both CLOCK and DATA lines are implemented on the keyboard end as open-collector outputs with pull-up resistors to +5V. It is possible (and sometimes necessary) for the host system to actively pull these lines LOW." ссылка http://oap.sourceforge.net/keyboard_...EYBOARDFAQ_005 ну и много где еще об этом написано.