Интересный глюк квартуса (не раз мне кровь попил)
Имеем:
out1(0) <= result(0);
out1(1) <= not(result(1));
Комперируем, RTL Viewer показывает первый рисунок. Всё правильно (out1(1) <= not(result(1)))

Теперь разгруперуем - второй рисунок - уже out1(1) <= (result(1))