А сильно ли нужны эти прерывания? Просто RT11 обычно не сильно многозадачная, а ресурсов PSoC4 вряд ли хватит. Сейчас уже реализован доступный по чтению регистр с флагом готовности. Ждать нужно будет только во время чтения/записи данных в карту.