Arseny, напрвление правильное, главное ограничится необходимым и достаточным.
Думаю что совместить SD HxC Floppy Emulator с контроллером HDD CF на плате размером под оригинальный корпус задача решаемая
А какой смысл совмещать Floppy Emulator без флоппи-контроллера? Вот замена КНГМД контроллером на основе SD карт позволит и без КНЖМД обойтись. Особенно, если сделать его поддерживающим работу одновременно с 4 образами как с 4 дисководами.