Откопал я у себя этот контроллер, посмотрел внимательнее. Ты будешь смеяться, но похоже, у тебя он работает как и должен
При загрузке io.sys спрашивает наличие накопителей через in 13h, соответственно, эта хрень щупает диски, и пока винт не выдаст сигнал DRIVE READY, контроллер просто висит, ждет. Нет винта, будет ждать вечно. Прицепи к нему винт, и после того, как шпиндель раскрутится и появится DRIVE READY, оно будет грузиться дальше. Я ж говорил, извращенцы...