И ещё один момент - не могут ли как-то влиять приоритеты прерываний двух DL-портов.

Может, в эмуляторе ДВК есть какая-то проблема с приоритетами прерываний, которая проявляется при одновременной работе RT-11 по прерываниям сразу через два DL-порта..