Почему второй индекс ДОЛЖЕН отключать сигнал выдачи данных?
Потому что битовая длина дорожки не кратна слову, а значит - содержимое сдвигового регистра после сигнала индекса каждого оборота чтения точно так же не имеет однозначного смысла, как и сразу после запуска режима чтения.