Titus, все же хотелось бы уточнить, что же это за Prescalar Clock. Объясните пожалуйста поподробнее, что Вы под этим подразумеваете.
Теперь по поводу загрузки счетчика: собственно в документации эти моменты прописаны, что счетчик (который не выводится ни на какие регистры) загружается из буферного регистра (177712) в следующих случаях:
  1. в режиме останова таймера;
  2. при обнулении (после формирования требования прерывания);
  3. при фиксации внешнего события (после формирования требования прерывания).