Тесты показали, что проблемы все-таки остались.
Форматирует не полностью 2490/2544, то есть не догрызает, причем по-разному даже на одном и том же диске, не догрызает примерно 50-60 секторов.
Читать - читает, и копирует с диска на диск спокойно...
Может если матрицу резистивную поставить эта проблема уйдет?