Почему бы не загрузиться с CD/флешки и не подготовить CF нормальными дос-утилитами? Они и правильную геометрию CF покажут.

Кстати, помнится мучился со снятием образа. Пара утилит под винду снимали его крайне криво, почему то путая сектора, и пришлось на работе воспользоваться старым-добрым DiskEdit из нортоновских утилит.
Ну или до завтра подожди, вечерком сделаю нормальные утилитки под винду, аналогичные досовским. Давно собирался, да руки не доходили