Думал я насчет сканера.
Сейчас наши микрофотопанорамы, сделанные традиционным способом имеют разрешение порядка 4К/мм. Линейка среднего сканера имеет разрешение 2-3К/дюйм, то есть 25-30 раз меньше, значит все равно нужна оптика микроскопа. Микроскоп просто такое большое поле зрения (чтобы его имело смысл сканером захватывать) с нужным разрешением не даст, сейчас все упирается именно в оптический тракт, имеющейся камеры в 9Мпикс вполне хватает.