Суть в том, что в тем микросхемах, которые дешево шлют китайцы с демонтажа, ноги jtag в большинстве случаев переназначаются под нужды прошивки, т к всегда свободных ног не хватает. И после этого прошить через jtag их уже нельзя,, а можно только через специальный параллельный программатор с высоковольтным режимом, который стоит как чугунный мост. Поэтому проще брать другую , более богатую ногами CPLD (100 и более), у которой ноги jtag с высокой долей вероятности не переназначены.
Но про это лучше почитать в профильных темах про ПЛИС.