В моём загрузчик тоже не учитывает таблицу разделов. Загрузка возможна только с раздела 0, при этом он должен начинаться с нулевого цилиндра.
В ту пору не было задачи грузиться с альтернативных разделов, да и вместить эту таблицу в блок загрузчика проблематично из-за ограничений по размеру. Дисков больше 20 МБ было раз-два и обчёлся на всю контору.