пилот и синхробайт для эмулятора не нужны.
они нужны для загрузки реального пк с реального магнитофона (или звуковой карты).
их назначение - подавить собственные шумы магнитной ленты и дать возможность компьютеру правильно определить начало блока данных и необходимость инверсии при чтении (физические тонкости бытовых магнитофонов). по этой же причине пилот и синхробайт в конце записи не требуются.
контрольная сумма в конце нужна для Радио-86РК. если ЮТ-88 ее не использует, то она, как минимум, не мешает.
для реального Специалиста я писал утилиту rks2wav (она есть в том пакете), можно ее попробовать и для ЮТ, только указать ключ, чтобы не генерировался дополнительный заголовок (в котором монитор спеца пишет имя файла). Но следует учесть, что у специалиста скорость записи выше чем у рк86, так что придется подбирать константу для чтения.