> Она к данному контроллеру подходит?
Да

>И еще один момент - надо ли создавать скрытую партицию, при разметке диска.
Нет

> При запуске команды WDR вылезает SuperBlock - CRC error. При повторной команде WDR норма.
Хреново. А что WDX при автодетекте пишет? Нормально название CF карты читается?

Какая модель и ёмкость CF карты?