сорри - не силён в альтере. ксайлинк у меня. но принцип тот же. IP-корки это к примеру та же ПЛЛ, процессор, UART, SPI, контроллер SDRAM итд. под ТОПом подразумевается то что написано своими руками для "склейки" сих корок. Сии корки - это уже кем то написанные исходники, проверены, отлажены, оптимизированы. В ксайлинксе это (корки) "оформлено" как отдельный комплект исходников(отдельный проект). В Вашем случае судя (ИМХО) по всему корки не используются совсем. PLL-в общем смысле да, является коркой, но по сути это всего лишь "обёртка" аппаратного модуля плисы.