Механизм для работы с сомнительными носителями - к/с каждого сектора, обрабатываемая в драйвере.
Ну и средства ОС RT-11 - например, отметить нечитающиеся ( ошибка к/с ) блоки как плохие.

Насчет замещения нехороших секторов - это вопрос к дровописателям. Можно, например, блоки каталога дублировать в хвосте массива.