Зависит от джойстика. Если его выходы работают по принципу open drain, то достаточно указанной доработки.
Если же его выходы push pull, то можно пожечь ПЛИС т.к. они выдают 5В, а для ПЛИС это небезопасное значение. Ну или, если запаяна предусмотренная на Сизифе защита от перенапряжения (U15 и U16), то можно пожечь джойстик из-за повышенного тока на его выходах.
В общем то это решаемо, например резисторами в разрыве сигнальных линий для ограничения тока.





Ответить с цитированием