У меня был геймпад с переключателем аналог-цифра. В одном эмуляторе работал стик, в другом наоборот крестовина. Если ещё переключатель правильно поставить.
Смутно помню, что в EmuZWin 2.8 больше понравилась работа с падом. Там крестовина работала.