Сама "Москва" работает исправно? Если софт писать-загружать на ней, имею в виду.
Если нет - возможно, сбоит ПЗУ ТР-ДОС на Москве, либо еще какие-то проблемы с контроллером.
Но чтоб прям 99% софта не работало - дело точно не в версии TR-DOS.