Под 98 отлично работают AMDCopier и SpectrumNavigator.
Чтобы записать на 3.5 дискету надо у неё одно окошко заклеить заклейкой. Смотри дискету: там два окошка. Одно для R/O другое для HD/DD. Вот если заклеишь - будет DD и всё нормально работает.