1) встроенного функционала сохранения кода у alasm нет. Оно, в принципе, и понятно- вдруг у тебя тыща кодовых блоков, разбросанная по основной и верхней памяти. Как ассемблер узнает, что именно и под каким именем ты хочешь сохранить? Для облегчения жизни есть макрос в поставке. Там же есть макрос для сохранения басиков
2) STS действительно переделана alco. В том числе и шрифт. Так что, либо пересобирай под себя (исходники в свободном доступе), либо юзай более старую версию (я вот например так и делаю)