Программ, у которых эта критичность критична, настолько мало, что вопрос кажется смешным. Решаем по месту. В случае Колобихи вопроса просто нет, потому что версия S.E.S. отличается существенно: там и интра и багфиксы какие-то и музло вставлено: -- берем и делаем новую карточку ибо и программа знаменита и интро знаменито и вообще. В случае чего-нибудь попроще можно оставить одну карточку с текстовым комментарием, так же как сейчас есть несколько игр, где патчеванные версии просто прилагаются в архивах. Кстати, поиск учитывает имена файлов, которые заданы в полях "имена файлов".

В принципе я могу в поиске сделать еще и выборку по типу процессора, чтоб не замусоривать категории. Не делал я этого просто потому что для меня неясен юзкейс такого поиска. Но, раз кому-то это существенно, можно забацать.