Всё оказалось гениально просто - в механике дисковода около шпинделя, который диск крутит, есть такая пластмассовая стекляшка, которая отсвечивает свет от светодиода гдето внутри на плате. И она отвечает (светит) за определение индексного отверстия. Она была пыльная, и видимо не давала нормального света, который улавливался бы фотодиодом через дырочку в дискете. Вымыл стекляшку - и всё заработало на ура!
alexeenko, за описание ещё раз сенкс. Ибо иначе я бы этот дисковод не прикрутил бы к спеку...