когда порт настроен на ввод, а схемно он предназначен на вывод - непонятно
Кроме как затычкой специфичной для схемы никак. Вывод как правило подтянут либо к нулю, либо к единице (чаще к единице). Значит, если такой вывод настроить на ввод, он прочитает то, к чему подтянута шина.