У меня на скорпе+ёлка+smuc+gs512+ентот самый контроллер с активной мышью и клавой(с переключателем AT/XT) и другой, просто AT-клавой никаких проблем нет. ZX клава тоже присутствует и постоянно подключена.
Плохо только, что у них третья кнопка не заюзана, а то у меня мыша как раз такая...

А что вообще за проблемы и в чём они выражаются(для понятия того, о чём идёт речь, а то непонятно...)