STS просто удобнее и быстрее, но заниматься отладкой по-живому не получится.
HDDoctor тут http://alonecoder.nedopc.com/zx/index.html
TDU (Turbo Disk Utility) и RDS тут http://zxsoft.zxby.org/#diskutil
CATHDD не могу найти ссылку

Я снимаю снапшот обычно после распаковки всех блоков загрузчиком, но до непосредственного запуска программы.