Pyhesty, ivagor уже почти на все успел ответить ;)
Да, BCD на данный момент в таймере не поддерживается, увы :(
Остановка процессора на обновление памяти эмулируется, причем с периодичностью, довольно точно соответствующей реальному Апогею и зависящей от настроек контроллера ЭЛТ.
Торможение проца на ПДП действительно не сказывается на таймере.

