Вообще, если смотреть на схему и быть точным, то на борту имеется две ПЛИС.
1. Это Altera GMX, она же EPF8282 по моему. У нее внтури статическая память, а это значит что в нее при каждом включении загружается прошивка. Так вот эта прошивка содержится в ПЗУ.
2. Это CPLD EPM7064 - это уже намертво зашитая и управляет внутренними процессами.

Так вот для первого случая необходимо просто считать ПЗУ и в одной из областей ПЗУ будет прошивка для EPF. А другую EPM необходимо просто считать с платы посредством программатора. Конечно если там не поставлен бит защиты.