У меня собрался кросс-компилятором из-под WSL:
http://sensi.org/~svo/b/besm6-x86_64.zip

Все как на странице http://www.besm6.org/wiki/Building.html , только в винде консоль у меня вместо UTF-8 печатает cp866, что выглядит так себе. Можно за выхлопом параллельно следить в файле log.txt.