iceoflame, да, все самое актуальное - на github'е.
Прошивка для альтеры ничем не отличается для разных ревизий плат, подходит к платам A,A2,B,B1,...
Правильно заливать вот этот pof: https://github.com/andykarpov/karaba...A.pof?raw=true